Entrepôts de confiance
Sur cette page, Recherche Data Gouv se fait le relai des entrepôts thématiques de confiance proposés par le Collège des Données de la recherche du Comité pour la science ouverte.
Le partage des données issues des activités de recherche implique de les mettre à disposition dans des entrepôts reconnus par les communautés scientifiques, thématiques, institutionnels ou généralistes.
Pour faciliter le travail des équipes de recherche, le collège des Données de la recherche propose une méthode d’identification des entrepôts thématiques de confiance, ainsi qu’une première liste d’entrepôts découlant de la grille de critères d’analyse retenus à découvrir ci-dessous.
Cette liste est évolutive et a vocation à être progressivement complétée par le collège des Données de la Recherche. Elle n’est par ailleurs pas exhaustive : ainsi, ne pas figurer dans la liste n’implique pas que l’entrepôt concerné n’est pas de confiance.
⚠️N’oubliez pas, la dernière version à jour de la liste de référence est celle publiée sur le site Ouvrir la Science.
📧 Pour toute question relative aux entrepôts de confiance, contactez le Collège des Données de la recherche du Comité pour la science ouverte.
(dernière mise à jour : juin 2026)
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> En savoir plus sur l'entrepôt ArrayExpress
Données acceptées
Données génomiques fonctionnelles à haut débit issues de puces à ADN ou de séquençage de nouvelle génération (mRNA et miRNA, génotypage par SNP, immunoprécipitation de la chromatine ChIP etc.)
Embargo
Oui
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> En savoir plus sur l'entrepôt BioImage Archive
Données acceptées
Données de bioimagerie, de la molécule à l’organisme. Microscopie optique, tomographie par projection optique, imagerie par résonance magnétique, imagerie par ultrasons, microscopie à super-résolution, imagerie photoacoustique, microscopie à champ lumineux, microscopie Brillouin, microscopie à force atomique
Embargo
Oui
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> En savoir plus sur l'entrepôt Cambridge Structural Database (CSD)
Données acceptées
Structures cristallines (molécules organiques et organométalliques)
Embargo
Oui
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> En savoir plus sur l'entrepôt Centre de données astronomiques de Strasbourg (CDS)
Données acceptées
Catalogues (ou tables) astronomiques ; relevés images du ciel
Embargo
Non ou non précisé
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> En savoir plus sur l'entrepôt Centre de données de physique des plasmas (CDPP)
Données acceptées
Plasmas solaires, séries temporelles, spectres, catalogues d’événements, produits dérivés, jeux de données issus de simulations
Embargo
Oui
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> En savoir plus sur l'entrepôt Centre de Données Socio-Politiques (CDSP)
Données acceptées
Résultats d’enquêtes nationales ou internationales, quantitatives ou qualitatives
Embargo
Oui
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> En savoir plus sur l'entrepôt Chemotion
Données acceptées
Molécules, réactions chimiques, données analytiques (spectres) protocoles et conditions d’expérimentation. Les résultats négatifs sont acceptés (réactions ayant échoué).
Embargo
Oui
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> En savoir plus sur l'entrepôt COllections de COrpus Oraux Numériques (CoCoON )
Données acceptées
Enregistrements sonores, métadonnées descriptives
Embargo
Oui
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> En savoir plus sur l'entrepôt Conservatoire National des Données 3D (CND3D)
Données acceptées
Modélisations, restitutions 3D d'artefacts, de monuments et sites
Embargo
Oui
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> En savoir plus sur l'entrepôt Data Station Archaeology (DANS)
Données acceptées
Journaux de terrain, rapports, listes, inventaires, bases de données, données statistiques, photographies, documents graphiques, audio, vidéo, SIG, rendus 3D, RDF, etc.
Embargo
Oui
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> En savoir plus sur l'entrepôt data.InDoRES (inventaire des données de recherche en environnement et sociétés)
Données acceptées
Données environnementales, écologiques et géographiques
Embargo
Oui
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> En savoir plus sur l'entrepôt Didómena
Données acceptées
Données de recherche issues de projets scientifiques en Sciences Humaines et Sociales
Embargo
Oui
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> En savoir plus sur l'entrepôt EaSy Data
Données acceptées
Données de longue traîne du système terre et de l'environnement (exemple : issues de projet), hors données d'observation prises en charge par les poles de données. Pas de format imposé mais des préconisations
Embargo
Oui
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> En savoir plus sur l'entrepôt ebrains
Données acceptées
Données expérimentales, de simulation, modèles computationnels, logiciels, brain atlas
Embargo
Oui
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> En savoir plus sur l'entrepôt EELS Data Base
Données acceptées
Données de spectrométrie, spectre, spectre d'exitation, spectroscopie de perte d'énergie, spectroscopie d'absorption des rayons X
Embargo
Oui
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> En savoir plus sur l'entrepôt Electron Microscopy Data Bank (EMPIAR)
Données acceptées
Données brutes d'images en cryomicroscopie électronique ; reconstructions 3D en miscroscopie électronique et de tomographie à rayons X
Embargo
Oui
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> En savoir plus sur l'entrepôt Endangered Languages Archive (ELAR)
Données acceptées
Enregistrements sonores, métadonnées descriptives
Embargo
Oui
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> En savoir plus sur l'entrepôt European genome-phenome archive (EGA)
Données acceptées
Données sensibles issues de recherches biomédicales. Séquences génétiques (formats génériques ou spécifiques). Puces à ADN : des fichiers de signaux bruts aux matrices. Phenotypes (tous formats). L'entrepôt est recommandé pour les données potentiellement réidentifiables et nécessitant un contrôle d'accès. Toute soumission requiert l'utilisation d'un outil de cryptage (crypt4gh). Pour les autres types de données génétiques, d'autres entrepôts sont à privilégier. https://ega-archive.org/submission/metadata/submission/FAQ/
Embargo
Oui
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> En savoir plus sur l'entrepôt European Nucleotide Archive (ENA)
Données acceptées
Séquences nucléotidiques. Données brutes et annotations
Embargo
Oui
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> En savoir plus sur l'entrepôt Genetic and Genomic Information System (GnpIS)
Données acceptées
Ressources génétiques, polymorphismes et données de génotypage, données de phénotypage, données d'association, cartes génétiques et QTL, données de synténie.
Embargo
Oui
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> En savoir plus sur l'entrepôt German Neuroinformatics Node (G-node)
Données acceptées
Neurophysiologie, électrophysiologie, spike sorting, neuroimagerie humaine et animale
Embargo
Non ou non précisé
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> En savoir plus sur l'entrepôt Global Biodiversity Information Facility (GBIF)
Données acceptées
Taxons, données d'occurrences, données d'échantillonnage, toutes standardisées selon les standards Darwin Core ou ABCD
Embargo
Oui
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> En savoir plus sur l'entrepôt Image Data Resource (IDR)
Données acceptées
Imagerie cellulaire et tissulaire humaine, animale et végétale. Données de référence sur les cellules et tissus : microscopie à super-résolution, l’imagerie en time-lapse, criblage à haut contenu, protocoles expérimentaux
Embargo
Oui
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> En savoir plus sur l'entrepôt ioChem-BD
Données acceptées
Fichiers d'entrée ou de sortie de suites de programmes de modélisation moléculaire quantique ou classique
Embargo
Oui
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> En savoir plus sur l'entrepôt IsoArcH
Données acceptées
Echantillons bioarchéologiques au format tableur ou pdf
Embargo
Oui
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> En savoir plus sur l'entrepôt Kinetic Database for Astrochemistry (KIDA)
Données acceptées
Réactions et propriétés de molécules d’intérêt pour la chimie des atmosphères planétaires et de l’espace interstellaire
Embargo
Non ou non précisé
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> En savoir plus sur l'entrepôt Long-term Access and Usage of Deeply Annotated Information (Laudatio)
Données acceptées
Corpus historiques transcrits et encodés en TEI
Embargo
Non ou non précisé
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> En savoir plus sur l'entrepôt MassBank
Données acceptées
Spectres de masse, entre autres à haute résolution. Molécules d'intérêt environnemental, en métabolomique et en exposomique
Embargo
Non ou non précisé
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> En savoir plus sur l'entrepôt MorphoSource
Données acceptées
Restitution 3D de vestiges biologiques, anthropologiques et d'artefacts
Embargo
Oui
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> En savoir plus sur l'entrepôt Nakala
Données acceptées
Données de recherche issues de projets scientifiques en SHS
Embargo
Non ou non précisé
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> En savoir plus sur l'entrepôt NeuroMorpho
Données acceptées
Reconstruction neuronale pour toutes les espèces, morphologie des neurones et de la glie
Embargo
Non ou non précisé
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> En savoir plus sur l'entrepôt nmrXiv
Données acceptées
Spectres RMN aux formats constructeurs et JCAMP-DX pour tous types d'échantillons
Embargo
Oui
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> En savoir plus sur l'entrepôt NOMAD
Données acceptées
Données de structure électronique (Input and output files of most electronic-structure codes)
Embargo
Non ou non précisé
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> En savoir plus sur l'entrepôt Open Context
Données acceptées
Inventaires et bases de données, photographies, documents graphiques, SIG
Embargo
Oui
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> En savoir plus sur l'entrepôt Open Reaction Database (ORD)
Données acceptées
Réactions chimiques, protocoles et conditions d’expérimentation. Les résultats négatifs sont acceptés (réactions ayant échoué)
Embargo
Non ou non précisé
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> En savoir plus sur l'entrepôt Outils et Ressources pour un Traitement Optimisé de la LANGue (ORTOLANG)
Données acceptées
Corpus, lexiques, terminologies, logiciels
Embargo
Non ou non précisé
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> En savoir plus sur l'entrepôt PANGAEA
Données acceptées
Données des géosciences (biologie, écologie, chimie, géologie, géophysique, météorologie, océanographie), essentiellement au format tabulaire (xlsx, CSV) avec une recommandation d'usage de trames de tableaux différentes selon les disciplines.
Embargo
Oui
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> En savoir plus sur l'entrepôt Pangloss
Données acceptées
Langues rares, peu étudiées ou décrites, en danger ou à tradition orale. Documents linguistiques sonores, données orales (enregistrements audio ou/et vidéo). Annotations pour chaque enregistrement : transcription, traduction et gloses interlinéarisées.
Embargo
Oui
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> En savoir plus sur l'entrepôt Paris Astronomical Data Center (PADC)
Données acceptées
Principalement des données du ciel en format fits, souvent images ou spectres, mais aussi simulations, données de labo, planétologie, radio, etc.
Embargo
Oui
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> En savoir plus sur l'entrepôt Protein Data Bank Europe (PDBe)
Données acceptées
Structures 3D de molécules biologiques (proteines, ADN, ARN)
Embargo
Oui
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> En savoir plus sur l'entrepôt PRoteomics IDEntifications (PRIDe)
Données acceptées
Données de spectrométrie de masse. De la donnée brute jusqu'à la cible identifiée
Embargo
Oui
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> En savoir plus sur l'entrepôt Public-nEUro
Données acceptées
Imagerie cérébrale (format BIDS, IRM, MEG, EEG, iEEG, TEP)
Embargo
Oui
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> En savoir plus sur l'entrepôt ShareLoc.XYZ
Données acceptées
Microscopie super-résolutive. Images SMLM en 2D ou 3D
Embargo
Oui
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> En savoir plus sur l'entrepôt SupraBank
Données acceptées
Interactions intermoléculaires, hôte-invité, protéine-ligand, polymères, adsorption
Embargo
Oui
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> En savoir plus sur l'entrepôt TRY Plant Trait Database
Données acceptées
Données biologiques (morphologiques, anatomiques, biochimiques, physiologiques ou phénologiques) sur les caractéristiques (traits) des plantes
Embargo
Oui
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