Array Express

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Génomique

Données acceptées

Données de génome

Institutions porteuses

European Molecular Biology Laboratory European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI)

Identifiants pérennes

DOI (sur demande)

Identifiant interne

Limite de volume

Limite de volume par fichier : Non-indiqué mais un protocole de dépôt particulier existe pour les jeu de données comprenant plus de 1000 fichiers.

Limite de volume par jeu de données : Pas de limite précisée

Modération assurée par l'entrepôt

Automatique et humaine. Le dépôt s'effectue via l'outil Annotare. Détails fournis ici : https://www.ebi.ac.uk/fg/annotare/help/submit_exp.html. Des contrôles supplémentaires d'intégrité sont opérés pour les données brutes de séquençage (fastq.gz) avant l'attribution d'un numéro d'accès au jeu de données.

Remarques

Données génomiques fonctionnelles à haut débit issues de puces à ADN ou de séquençage de nouvelle génération (mRNA et miRNA, génotypage par SNP, immunoprécipitation de la chromatine ChIP etc.)  Les jeux de données comprennent généralement des annotations d'échantillons, des protocoles, des données d'analyse et des données brutes. L'ensemble des types d'expériences déposées dans l'entrepôts sont signalées ici : https://www.ebi.ac.uk/fg/annotare/help/experiment_types.html.

Déposer / Publier un jeu de données